Gmina Werbkowice położona jest w zachodniej części powiatu hrubieszowskiego, jej powierzchnia wynosi 188,26 km2, co stanowi 14,83% powierzchni powiatu.
Gmina Werbkowice jest gminą graniczną powiatu, sąsiaduje ona z gminami:
-
Hrubieszów od północnego wschodu,
-
Mircze od południowego wschodu,
-
Tyszowce od południa,
-
Miączyn od zachodu,
-
Trzeszczany od północy.
